전공6 [생화학I] 7. 미오글로빈과 헤모글로빈, Heme 구조 단백질이 보편적으로 가지는 특징을 앞선 글에서 다루어보았다. 그렇다면 앞으로 몇개의 글을 통해 대표적인 단백질 미오글로빈과 헤모글로빈을 통해서 단백질이 실제로 체내에서 어떻게 활용되고, 활성 정도를 어떻게 해석하고, 경우에 따라 어떻게 조절되는지를 알아보도록 하겠다. 미오글로빈과 헤모글로빈의 역할과 구조미오글로빈(Myoglobin)과 헤모글로빈(Hemoglobin)의 가장 중요한 역할은 산소 운반이다. 사람을 비롯한 대부분의 생물은 산소 호흡을 도입하였기 때문에 신체를 이루는 모든 세포에 산소가 원활히 공급되어야 한다. 만약 생명체의 크기가 아주 작아서 외부와 바로 산소 교환을 원활히 할 수 있다면 상관 없겠지만, 우리 주변의 대부분의 생명체는 그렇지 않다. 그렇기 때문에 산소 운반을 도와주는 메커니즘이.. 2023. 7. 9. [생화학I] 5. 단백질의 2차 구조 (1) 알파 나선 앞선 글에서도 언급했지만 단백질은 1차 구조부터 4차 구조까지 여러 단계로 구성되어 있다. 3차 구조와 4차 구조는 결국 세부적인 2차 구조의 조합과 상호작용으로 구성되기 때문에 2차 구조를 아는게 아주 중요하다고 할 수 있겠다. 그러면 대표적인 2차 구조 중 하나인 알파 나선(Alpha-Helix)에 대해 알아보자. 알파 나선 구조가 뭔지 알아보자알파 나선 구조는 이름 그대로 폴리 펩타이드 사슬이 마치 코일처럼 반복해서 회전하는 구조로 나타나는 것을 말한다. 아래 그림을 보면 대략 알파 나선 구조가 어떤 모습을 보이는지 알 수 있다. 만약 단백질의 구조를 나타낸 그림에서 나선이 발견되면 대부분 이 알파 나선이 있음을 나타낸다. 아래 그림은 이상적인 나선의 예시를 나타낸 것인데 n, p, right-ha.. 2023. 7. 6. [생화학I] 4. 펩타이드 결합과 Ramachandran Plot 앞서 배운 아미노산은 단백질을 이루는 기본적인 단위체이다. 아미노산은 다른 아미노산과 펩타이드 결합을 형성함으로써 단백질을 구성한다. 그래서 이번 글에서는 펩타이드 결합이 어떻게 형성되는지, 어떤 특징을 가지는지, 더 나아가서는 Ramachandran Plot이 어떤 의미를 가지는지에 대해서 알아보려고 한다. 펩타이드 결합은 뭔가요? 펩타이드 결합은 한 아미노산의 카복실기와 다른 아미노산의 아미노기 사이에 형성되는 아마이드 공유 결합을 의미한다. 펩타이드 결합을 통해 형성되는 생성물을 펩타이드라고 부르는데, 연결되는 아미노산 단위체(영어 표현인 Residue로도 많이 부른다)의 개수에 따라서 Dipeptide(아미노산이 2개), Tetrapeptide(아미노산이 4개)와 같이 펩타이드에 접두사가 붙기도 .. 2023. 7. 3. [생화학I] 3. 특이한 아미노산 3가지 (프롤린, 시스테인, 히스티딘) 20개의 주요 아미노산 모두 중요하지만 그중에서도 몇 아미노산은 특이해서 짚고 넘어가야할 점들이 있다. 순서대로 프롤린, 시스테인, 히스티딘을 알아보려고 한다. 1. 프롤린 (Proline)프롤린은 20개의 아미노산 중에서 유일하게 Side chain이 아미노기와 공유 결합을 형성하는 아미노산이다. 아래에 나와있는 프롤린의 구조를 보면 NH에 연결된 알파탄소로부터 고리가 형성되는 것을 관찰할 수 있다. (알파탄소에 고리가 있는 Side chain이 결합한 게 아닌, 알파탄소 자신이 고리구조에 포함되어 있는거다!) 이 때문에 3차원 구조가 다른 아미노산과는 독특한 양상을 보이게 되는데, 이후 펩타이드 결합을 형성할 때 영향을 미치게 된다. 나중에 다룰 Ramachandran Plot에서도 같은 이유 때문에.. 2023. 6. 30. [생화학I] 2. 아미노산의 구성과 특징 생명체를 구성하는 4개의 Macromolecule(거대분자)인 탄수화물(Carbohydrate), 단백질(Protein), 지질(Lipid), 핵산(Nucleic acid)은 생명과학을 공부하다보면 다루지 않을 수가 없는 물질들이다. 그 중 단백질에 특히 주목하는 이유는 단백질은 효소를 구성하는 주요 구성요소이기 때문이다. 생명체 내의 물질대사는 효소에 의해 이뤄지고 또 통제되기 때문에 단백질을 모르고서 생화학을 공부하는 건 불가능에 가깝다. 그렇다면 단백질은 뭘로 구성되나요? 단백질의 기본 단위는 아미노산(Amino Acid; 축약어 AA)이다. 아미노산은 탄소를 중심으로 아래에 적혀있는 4개의 그룹이 부착된 형태이다. 이때 네 그룹을 연결하는 중심에 있는 탄소를 알파 탄소라고 부르기도 한다. (알파 .. 2023. 6. 29. [생화학I] 1. 생화학이 대체 뭐하는 과목인데 원래 이 블로그는 내가 고등학생일 때 짧게 운영했다가 사실상 방치된 상태로 있었다. 그런데 어라? 방문자 수가 생각보다 꾸준히 나오는 걸 확인해버렸다. 특히 시험 기간 버프를 받았는지 매 학기마다 꾸준히 방문자가 늘어서 최근에는 누적 방문수 55만을 기록했다. 와! 블로그 주인이 18년 이후로 손을 놔도 알아서 굴러가는 블로그라니. 이거 새로운 컨텐츠로 보답을 안 할 수가 없다. 그래서 생명과학에서 가장 중요한 두 축이 되는 생화학과 분자생물학에 대한 글을 방학동안 열심히 적어보려고 한다. 그러면 가을 쯤에는 학생들이 많이 봐주지 않을까? 그래서 생화학I 포스트에는 무엇을 어떻게 다루나요? 우선 생화학은 생명체 내에서 진행되는 여러 화학 반응들의 메커니즘을 화학적으로 설명하는 학문이다. 생화학은 생명과학.. 2023. 6. 28. 이전 1 다음
